История Свято-Пантелеймоновой русской обители на новом месте началась в 1760 году. Основана она была в той местности, где монах Христофор в конце XVII века построил небольшую церковь, причал (арсана) и келью.

Первое время монастырь «Святого Пантелеимона» придерживался идиоритмического устройства, и только в 1803 году Вселенский Патриарх Каллиник специальной грамотой объявил его киновией.

Понимая значение и предвидя будущее процветание русского монастыря, патриарх Каллиник, решительно отвергал все намерения Священного Кинота упразднить русскую обитель и передать его имения другим монастырям в счет неуплаченных долгов. Он считал, что было бы «неприлично и неполитично» упразднять русскую афонскую обитель как раз в то время, когда Россия после своих последних войн с Турцией, приобрела довольно сильное и решительное влияние в судьбе восточных христиан.

Первый игумен монастыря Святого Пантелеимона Савва Пелопонниский был греком по происхождению, и ранее подвизался в ските Ксенофонта. Именно благодаря его неутомимой энергии и энтузиазму за очень короткое время удалось добиться расширения монастыря и улучшения его материального благосостояния.